分取、精製を行う上で重要なポイントは、目的成分を効率的に高純度で得ることにあり、他成分と十分に分離されなければなりません。
分離は移動相条件、カラムの長さ、さらにはリサイクル分取を行う事によって改善は可能ですが、表面積や炭素量が大きい保持力の強いカラムを使用する事で、より簡便に改善できる場合があります。
また、試料溶媒にDMSOなどの溶出力の強い溶媒を使用する場合、移動相と試料溶媒の溶出力の差が大きいとピーク形状が悪化し、分取、精製の効率が落ちることがあります。このような場合にも保持が強いカラムを選択することにより、その影響を軽減することが可能です。